pdb файл чем открыть
Что такое файл PDB?
Файл с расширением PDB – это, скорее всего, файл, созданный в формате программной базы данных, который используется для хранения отладочной информации о программе или модуле, например, DLL или EXE-файл. Их иногда называют символьными файлами.
Файлы PDB отображают различные компоненты и операторы в исходном коде в свой конечный скомпилированный продукт, который затем может использоваться отладчиком для поиска исходного файла и местоположения в исполняемом файле, в котором он должен остановить процесс отладки.
Вместо этого некоторые файлы PDB могут быть в формате файла Protein Data Bank. Эти файлы PDB представляют собой простые текстовые файлы, которые хранят координаты относительно структур белка.
Как открыть файл PDB
Различные программы используют свой собственный файл PDB для хранения данных в некотором виде структурированной базы данных, поэтому каждое приложение используется для открытия своего собственного типа файла PDB. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio и Pegasus – вот лишь несколько примеров программ, которые могут использовать файл PDB в качестве файла базы данных. Radare и PDBparse могут также работать для открытия файлов PDB.
Некоторые файлы PDB хранятся в виде обычного текста, например файлы базы данных отладки программы Geneious, и полностью читаемы человеком, если открыты в текстовом редакторе. Вы можете открыть этот тип файла PDB с помощью любой программы, которая может читать текстовые документы, например, встроенной в Windows программы «Блокнот». Некоторые другие средства просмотра и редактирования файлов PDB включают Notepad ++ и Brackets.
Другие файлы базы данных PDB не являются текстовыми документами и полезны только при открытии с программой, для которой они предназначены. Например, если ваш файл PDB каким-либо образом связан с Quicken, попробуйте использовать это программное обеспечение для просмотра или редактирования файла PDB. Visual Studio ожидает увидеть файл PDB в той же папке, что и файл DLL или EXE.
С помощью Avogadro вы можете просматривать и редактировать файлы PDB, являющиеся файлами банка протеиновых данных, в Windows, Linux и macOS. Jmol, RasMol, QuickPDB и USCF Chimera также могут открывать файл PDB. Поскольку эти файлы представляют собой простой текст, вы можете открыть файл PDB и в текстовом редакторе.
Как конвертировать файл PDB
Файлы базы данных программы, скорее всего, не могут быть конвертированы в другой формат файла, по крайней мере, с помощью обычного инструмента конвертации файлов. Вместо этого, если есть какой-либо инструмент, который может конвертировать этот тип файла PDB, это была бы та же самая программа, которая может открыть его.
Например, если вам нужно преобразовать файл базы данных PDB из Quicken, попробуйте использовать эту программу для этого. Однако этот тип преобразования, вероятно, не только мало полезен, но и не поддерживается в этих приложениях базы данных (т. Е. Вам, вероятно, не нужно преобразовывать этот тип файла PDB в любой другой формат).
Если вам не нужна цветная модель, вы можете экспортировать файл PDB напрямую в STL с помощью USCF Chimera (ссылка для скачивания приведена выше). В противном случае вы можете использовать тот же метод, что и выше (с MeshLab), чтобы конвертировать PDB в WRL с USCF Chimera, а затем экспортировать файл WRL в STL с MeshLab.
Преобразовать PDB в PDF или EPUB, если у вас есть файл PalmDOC, можно несколькими способами, но проще всего, вероятно, использовать онлайн-конвертер PDB, такой как Zamzar. Вы можете загрузить свой файл PDB на этот веб-сайт, чтобы иметь возможность конвертировать его в эти форматы, а также в форматы файлов AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT и другие.
Преобразовать файл PDB в формат FASTA можно с помощью онлайн-конвертера Meiler Lab в PDB в FASTA.
Также возможно конвертировать PDB в CIF (формат кристаллографической информации) онлайн, используя PDBx/mmCIF.
Расширенное чтение файлов PDB
Вы можете прочитать намного больше о файлах базы данных программ от Microsoft, GitHub и Wintellect.
Также есть больше информации о файлах Protein Data Bank; см. Всемирный банк протеиновых данных и RCSB PDB.
Ваш файл все еще не открывается?
Файлы PDB, которые не открываются ни одним из перечисленных выше инструментов, скорее всего, не являются файлами PDB. Может случиться так, что вы неправильно читаете расширение файла; некоторые форматы файлов используют суффикс, который очень похож на «.PDB», когда они действительно не связаны и не работают одинаково.
Например, файл PDF является файлом документа, но большинство программ из приведенного выше не будут корректно отображать текст и/или изображения, если вы попытаетесь открыть их с помощью этих программ. То же самое верно и для других файлов с одинаковыми расширениями файлов, таких как файлы PD, PDE, PDC и PDO.
PBD – это еще одна программа EaseUS Todo Backup, поэтому она полезна только при открытии с этим программным обеспечением.
Если у вас нет файла PDB, изучите расширение файла, которое есть у вашего файла, чтобы вы могли найти соответствующую программу, которая открывает или конвертирует его.
Pdb файл чем открыть
Название (англ.): Palm Desktop Database File
Название (рус.): Файл базы данных Palm Desktop
Описание: PDB также известный как Palm Desktop Database File представляет собой формат файла базы данных используемый в операционной системе Palm OS. Разработчиком данного формата является Palm – американская компания, специализирующаяся на производстве программного обеспечения для ОС Palm, а также смартфонов и карманных компьютеров. Файлы этого типа используются для хранения различных данных. Их внутреннее содержимое может быть представлено графикой, текстом, картами, базами данных и т.п. Форматом поддерживается форматирование текста, а также использование стилей шрифтов. В Windows файлы PDB могут быть открыты с помощью XnView, Calibre и некоторых других программах.
Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:
Формат 2
Название (англ.): Program Database File
Название (рус.): Файл базы данных
Разработчик: Нет данных
Описание: PDB или Program Database File представляет собой формат файла базы данных. Файлы этого типа могут быть используемы различным программным обеспечением, к примеру, такими приложениями как MS Visual Studio, Intuit Quicken. Содержащаяся в них информация хранятся в строго структурированном виде. Как правило, файлы PDB сохраняются в собственном формате. При этом конкретный PDB-файл может быть открыт только той программой, которая его создала. Например, PDB-файл, созданный с помощью Microsoft Visual Studio нельзя будет открыть в Palm Pilot.
Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:
Формат 3
Название (англ.): Protein Data Bank File
Название (рус.): Данные молекул белков и нуклеиновых кислот
Описание: PDB также известный как Protein Data Bank File представляет собой специальный формат файла данных. Файлы этого типа можно встретить в программах, предназначенных для хранения результатов исследований в сфере биологии и биохимии. Разработчиком данного формата является wwPDB. Внутреннее содержимое PDB-файлов представлено трехмерными координатами, описывающими атомную структуру белкового или другого химического соединения. В настоящее время формат PDB является стандартным форматом хранения данных, полученных в результате изучения белковых соединений. Просмотреть файлы PDB можно с помощью специальных программ QuteMol, RasMol или Avogadro.
Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:
Формат 4
Название (англ.): PowerDesigner Database Backup File
Название (рус.): Резервная копия базы данных PowerDesigner
Описание: PDB иначе PowerDesigner Database Backup File представляет собой собственный формат файла резервной копии используемой в PowerDesigner – профессиональном программном инструменте для создания моделей данных и разработки архитектуры предприятий. Разработчиком формата является Sybase – американская компания, специализирующаяся на производстве программного обеспечения для управления базами данных. Внутреннее содержимое файла PDB обычно представлено информацией из базы данных, а также ссылками на другие файлы. Предназначаются PDB-файлы для создания резервной копии основной базы данных. Открыть их можно с помощью «родной» программы PowerDesigner.
Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:
.pdb Расширение файла
Тип файла1 Program Database
This file is saved in a binary format, which requires a specific program to read its contents.
Что такое PDB файл?
Файлы PDB, используемые различными программами, обычно сохраняются в проприетарном формате, то есть они могут быть открыты только программой, с которой они были установлены. Например, файл Intuit Quicken PDB не распознается Microsoft Visual Studio.
Visual Studio использует файлы PDB для хранения отладочной информации о программе, включая информацию о символах, которая слишком велика для хранения в программе сам. Информация о символе состоит из списка всех символов в программном модуле с адресами, именем файла и линией, в которой был объявлен символ. Вы можете использовать Visual Studio для загрузки информации из файла PDB для отладки программы.
Тип файла2 Protein Data Bank File
This file is saved in a binary format, which requires a specific program to read its contents.
.PDB вариант № 2
Файл данных, созданный в формате банка белков (PDB); хранит 3D-координаты, определяющие структуру атомов в белке или другом химическом соединении; используется в качестве стандартного формата для изучения белковых структур; также используется Исследовательской коллегией для структурной биоинформатики (RCSB) для изучения биологических макромолекул.
Многие файлы банка данных протеина доступны через Всемирный банк данных о белках (wwPDB), организации, которая архивирует макромолекулы и свободно распространяет их.
ПРИМЕЧАНИЕ. Файлы PDB часто просматриваются в пределах Java-апплет, который использует Jmol, пакет визуализации молекул с открытым исходным кодом. Файлы PDB также поддерживаются некоторыми плагинами браузера молекулярного просмотра.
Как открыть PDB файлы? 4 простых метода решения таких проблем
Когда вы сталкиваетесь с проблемой с неизвестным файлом PDB и не знаете, как открыть такой файл, первый шаг, который вы должны сделать, это определить причину данной проблемы. Мы покажем вам, как решить наиболее распространенные проблемы с файлами PDB и как их решить, в 4 простых шага.
PDB расширение файла
Как открыть файл PDB?
В некоторых случаях проблемы могут возникнуть при попытке открыть файлы PDB. Приведенные ниже шаги могут быть полезны для решения таких проблем.
Шаг 1 – Убедитесь, что файл правильно связан с выбранным программным обеспечением
Первое, что пользователь должен сделать, это связать приложение с файлами PDB. Может случиться так, что даже если в системе установлено приложение, поддерживающее файлы PDB, оно не будет правильно связано с этим форматом файла. Это можно легко исправить, связав программу с файлами PDB. Чтобы связать такие файлы с данным приложением, пользователь должен открыть меню файлов (щелкнув правой кнопкой мыши по файлу) и выбрав «Открыть с помощью». Список предлагаемых приложений будет отображаться в верхней части меню. Затем выберите приложение и подтвердите свой выбор, установив флажок «Всегда использовать выбранное приложение для открытия файлов такого типа». Подтвердите свой выбор, нажав ОК.
Чтобы открыть PDB файл, сфокусируйтесь на шагах 1 и 2
В большинстве случаев для открытия файлов с расширением PDB должно быть достаточно следующих инструкций на шаге 1 и 2. Прежде чем предпринимать следующие шаги, протестируйте все программы, перечисленные ниже.
Шаг 2 – Установите программу, которая поддерживает PDB файлы
Если случится так, что раздел с предлагаемыми программами будет пустым, наиболее вероятно, что в системе не будет установлена программа, поддерживающая файлы PDB. Выберите программу из следующего списка и установите ее:
Чем открыть pdb
Название формата Файл базы данных Palm Desktop
Оригинальное название Palm Desktop Database File
Разработчик: Palm
Описание расширения
В таких файлах может храниться различная информация: электронные книги, статьи, базы данных, изображения, карты и т.д.
Формат поддерживает различные написания шрифтов (жирный, курсивный, подчеркнутый, зачеркнутый и др.) и форматирование текста (слева, справа, по центру).
Чем открыть PDB Palm Desktop
Mobipocket Reader
XnView
Calibre
Формат pdb, вариант 2:
Название формата Файл базы данных
Оригинальное название Program Database File
Разработчик: Нет данных
Описание расширения
Такой файл базы данных может использоваться различными приложениями, такими как MS Visual Studio, Pegasus, Quicken, Palm Pilot.
Данные хранятся в структурированном виде. PDB-файлы, как правило, сохраняются в собственном формате, то есть они могут быть открыты только соответствующей программой.
Так, Pegasus не распознает PDB-файл от Microsoft Visual Studio.
Чем открыть PDB Microsoft Visual Studio
Формат pdb, вариант 3:
Название формата Данные молекул белков и нуклеиновых кислот
Оригинальное название Protein Data Bank File
Разработчик: wwPDB
Описание расширения
Файл данных в формате Protein Data Bank (PDB). Содержит 3D-координаты, определяющие структуру атомов внутри белка или другого химического соединения, используется в качестве стандартного формата для изучения белковых структур.
Protein Data Bank — банк данных 3D структур белков и нуклеиновых кислот. Информация, полученная методами рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии, вносится в базу данных биологами и биохимиками со всего мира, и доступна бесплатно через интернет.
PDB является один из важнейших ресурсов для учёных, работающих в области структурной биологии. Большинство научных журналов и некоторые фонды финансирования исследований требуют от авторов статей и получателей грантов, чтобы все структурные данные были размещены в PDB.
Открыть PDB-файл помогут специализированные программы, например бесплатная программа QuteMol позволяет открывать и просматривать файлы с расширением *.pdb и *.vdb.
Формат pdb, вариант 4:
Название формата Резервная копия базы данных PowerDesigner
Оригинальное название PowerDesigner Database Backup File
Разработчик: Sybase
Описание расширения
Включает в себя как данные из базы данных, так и ссылки на другие файлы. Создается в качестве резервной базы на случай восстановления основной.
В нем сочетаются возможности моделирования UML-объектов с возможностями традиционного проектирования баз данных и анализа.
Не нашли описания?
Напишите. Оно обязательно появится на сайте.
Популярные расширения
Распространенный формат для документов старых версий Microsoft Word
Видео, записанное в формате QuickTime (Apple)
Аудио, кодированное без потери качества. Есть поддержка тегов.
Образ CD или DVD диска, служит для создания копий дисков.
Расширение векторного изображения CorelDRAW.
Популярные программы
Простой и многофункциональный видеопроигрыватель
Пожалуй, лучший бесплатный медиа-проигрыватель
Очень удобная программа-просмотрщик графики с огромным набором функций
Наиболее популярный векторный графический пакет
Самый быстрый и один из лучших иинтернет-браузеров